Mit der Naturwissenschaftlichen Fakultät der Paris Lodron Universität Salzburg besteht eine enge Kooperation – diese betrifft sowohl die gemeinsame Forschung (z. T. auch die Nutzung gemeinsamer Infrastruktur) als auch die Lehre. In mehreren Studiengängen werden die Lehrveranstaltungen von der Naturwissenschaftlichen Fakultät abgehalten – insbesondere der Kurs „Medizinische Basiswissenschaften“ (Biologie, Physik, Chemie) im ersten Studienjahr der Humanmedizin. Den Studierenden der Paracelsus Universität stehen eigene Laborräumlichkeiten sowie diverse andere Einrichtungen wie Mensa oder Bibliothek zur Verfügung.

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